水稻良種在種植一段時間后會出現退化的現象，表現在抗性減弱，穗型變小，結實率降低，籽粒不飽滿，莖稈細軟、高低不一，成熟不一致，產量降低，品質變差等。良種退化的原因有很多，主要有以下幾個原因：

　　（1）機械混雜。主要是在水稻生產過程中發(fā)生，如種子處理、播種育秧、移栽、補苗、收割、脫粒、翻曬、貯藏和運輸過程中，由于人為因素發(fā)生品種間混雜，降低了良種純度，影響生長整齊和豐產性。

　?。?）生物學混雜。指品種間或亞種間天然雜交，使后代逐漸發(fā)生變異，造成良種混雜。而生產上使用的由雜交育成的新品種，如遺傳性不穩(wěn)定，其后代也有可能分離。

　　（3）不良環(huán)境、栽培條件的影響。品種的優(yōu)良特性發(fā)揮都要求一定的環(huán)境條件，在這些條件不能滿足時，就會發(fā)生變異，促使品種退化。

　　（4）選留種的選擇標準不明確。在水稻選留種時片面注意穗大粒多的特性，而對其他性狀如分蘗、高矮、抗性等考慮不夠，也會引起退化。